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OncoScan®芯片能够从质量有限且高度变性和降解的FFPE样的DNA中,准确测定实体瘤中的拷贝数变化和等位基因不平衡,包括杂合性缺失(LOH)等信息。在实体瘤研究中FFPE样本由于容易存储而占绝大多数,而FFPE样本存在高度降解、获得DNA数量有限的问题,从实体瘤组织中获得全基因组拷贝数和杂合性缺失信息,一直是一个巨大的挑战。传统的FISH和PCR技术存在分辨率低、位点有限的瓶颈,NGS虽然也能用于突变检测,但要从异质性的FFPE样本中获得全基因组拷贝数信息,仍面临目标富集和深度测序的重大的挑战。
OncoScan®芯片利用分子倒置探针(MIP)技术,这是一种分析拷贝数变化、杂合性缺失和检测获得性突变的成熟技术。研究表明,此芯片已经经过多方面验证,对高度降解的DNA-例如那些来源于各个不同时期的、经福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)保存的肿瘤样本的DNA;或DNA起始量很低的样本均能表现出色,使得该芯片成为癌症临床研究的必然之选。
芯片特点:
l 只需要很少的起始样本量,快速获得-从80ng FFPE来源的DNA到结果的获得秩序48小时
l 一种分析,多种数据-全基因组拷贝数分析、基因组中≤10MB的杂合性缺失(LOH),和关键获得性突变的检测
l 低至25%的异常细胞嵌合体的拷贝数变化的检测,同时可检测线性拷贝数范围可高达50个拷贝
l 重点癌基因中高分辨率(50-125kb)的拷贝数检测
l 快速分析-在数分钟内分析几百个样本的拷贝数信息
l 以~20%的灵敏度检测常见的获得性突变位点
货号 |
产品 |
包装 |
902695 |
OncoScan® CNV FFPE Assay Kit |
24个样本 |
902293 |
OncoScan® FFPE Assay Kit |
24个样本 |